Studenci Instytutu Historii Kościoła podejmujący specjalizację w zakresie patrologii mają do wyboru trzy nurty przedmiotowo-badawcze:
1. Patrologia grecka – komplementarna problematyka związana z greckimi Ojcami Kościoła, agapetologia patrystyczna, teologia greckich Ojców Kościoła, aretologia patrystyczna, kaznodziejstwo Ojców Kościoła, zastosowanie myśli patrystycznej we współczesnym duszpasterstwie.
2. Patrologia łacińska – dzieje patrologii łacińskiej, łacińscy Ojcowie Kościoła, pastoralny aspekt patrologii, liturgia i hagiografia patrystyczna, pedagogika patrystyczna, eklezjologia patrystyczna, Kościół w społeczeństwie pluralistycznym doby patrystycznej.
3. Teologia i literatura patrystyczna – myśl teologiczna Ojców Kościoła, teologia kapłaństwa doby patrystycznej, egzegeza szkoły aleksandryjskiej, patrystyczna teologia duchowości, recepcja antycznej myśli greckiej w literaturze patrystycznej, chrystologia, trynitologia i eschatologia patrystyczna, herezje wczesnochrześcijańskie i reakcja Ojców Kościoła.
