Władze Instytutu Jana Pawła II stanowią: Zarząd i Rada Naukowa. W skład Zarządu wchodzą: ks. dr hab. Alfred M. Wierzbicki, prof. KUL – od 1 XII 2006 r. dyrektor Instytutu, mgr Cezary Ritter - sekretarz, dr Stanisław Majdański – członek, dr Kazimierz Krajewski – członek.
Prof. dr hab. Tadeusz Styczeń SDS - założyciel i przez blisko 25 lat dyrektor Instytutu, od dnia 1 grudnia 2006 r. pozostawał jako jego Dyrektor Honorowy; zmarł 14 X 2010 r.
Radę Naukową konstytuuje obecnie 40 profesorów, reprezentujących różne ośrodki naukowe w kraju - z początkiem 2007 r. przewodniczenie jej zostało powierzone prof. dr hab. Andrzejowi Szostkowi MIC. Kard. prof. dr hab. Stanisław Nagy SCJ, pełniący tę funkcję przez 25 lat od początku istnienia Instytutu, jest obecnie jej Honorowym Przewodniczącym.
ZARZĄD INSTYTUTU JANA PAWŁA II
Dyrektor ks. dr hab. Alfred M. Wierzbicki, prof. KUL, tel. 445-32-17, 445-32-20
Zastępca [vacat]
Sekretarz mgr Cezary Ritter, tel. 445-32-17
Członkowie
- dr Stanisław Majdański
- dr Kazimierz Krajewski
