Pion Rektora:

Wydziały:

• Wydział Teologii
• Wydział Prawa, Prawa Kanonicznego i Administracji
• Wydział Filozofii
• Wydział Nauk Humanistycznych
• Wydział Nauk Społecznych
• Wydział Medyczny
• Wydział Nauk Przyrodniczych i Technicznych
• Filia KUL w Stalowej Woli

Inne jednostki:

• Dział Organizacyjno-Prawny
• Dział Spraw Pracowniczych
• Kancelaria Ogólna
• Kancelaria Rektorska
• Kwestor
• Inspektor ochrony danych
• Audytor Wewnętrzny

Pion Prorektora ds. kształcenia:

• Centrum Polonijne KUL
• Dział Kształcenia
• Uniwersyteckie Centrum Rozwijania Kompetencji
• Szkoła Języka i Kultury Polskiej
• Studium Języków Obcych
• Studium Wychowania Fizycznego i Sportu
• Centrum Arbitrażu i Mediacji
• Centrum Polsko-Chińskie KUL
• Centrum Dydaktyki Akademickiej

Pion Prorektor ds. studentów i umiędzynarodowienia:

• Biuro Karier KUL
• Centrum Aktywizacji Osób z Niepełnosprawnością KUL
• Dział Administracji Domami Studenckimi
• Dział Studenckich Spraw Socjalnych
• Dział Współpracy Międzynarodowej
• Centrum Badań nad Dyplomacją KUL
• Organizacje studentów i doktorantów
• Centrum Relacji Katolicko-Żydowskich im. Abrahama J. Heschela KUL

Pion Prorektora ds. misji

• Akademia Nowoczesnych Mediów i Komunikacji KUL
• Archiwum Uniwersyteckie
• Muzeum KUL
• Kancelaria Tajna
• Duszpasterstwo Akademickie
• Centrum Badań nad Historią Polskiego Państwa na Uchodźstwie
• Centrum Badań nad Organizacjami Polonijnymi za Granicą

Pion Prorektora ds. Collegium Medicum:

• Collegium Medicum

Pion Prorektora ds. klinicznych i rozwoju
badań medycznych:

• kliniki

Pion Pełnomocnika ds. nauki:

• Centrum Komercjalizacji Nauki
• Dział Ewaluacji Działalności Naukowej
• Dział Projektów Naukowych
• Dział Strategii  i Rozwoju Uniwersytetu
• Szkoła Doktorska KUL
• Wydawnictwo KUL
• Rzecznik patentowy
• Biblioteka Uniwersytecka KUL
• Centrum Oceny Nauki i Techniki
• Laboratorium Humanistycznych Danych Badawczych KUL
• Centrum Studiów Mediewistycznych
• Centrum Psychologiczno-Psychiatryczne KUL
• Centrum Zastosowań Sztucznej Inteligencji
• Dział Projektów Akademickich

Pion Pełnomocnika ds. administracji i inwestycji:

• Dział Administracji Obiektami KUL
• Dział Inwestycji i Remontów
• Dział Ochrony, Bezpieczeństwa i Higieny Pracy
• Dział Zakupów i Zamówień Publicznych
• Dział Obsługi Filii KUL w Stalowej Woli
• Centrum Edukacyjno-Kongresowe KUL w Tomaszowie Lubelskim

Pion Pełnomocnika ds. IT:

• Dział Teleinformatyczny