Pion Rektora:

Wydziały:

• Wydział Teologii
• Wydział Prawa, Prawa Kanonicznego i Administracji
• Wydział Filozofii
• Wydział Nauk Humanistycznych
• Wydział Nauk Społecznych
• Wydział Medyczny
• Wydział Nauk Przyrodniczych i Technicznych
• Filia KUL w Stalowej Woli

Inne jednostki:

• Kancelaria i Gabinet Rektora 
• Dział Organizacyjno-Prawny
• Dział Spraw Pracowniczych
• Rzecznik prasowy
• Akademia Nowoczesnych Mediów i Komunikacji KUL
• Inspektor ochrony danych
• Audytor Wewnętrzny

Pion Prorektor ds. nauki i kadr:

• Biblioteka Uniwersytecka KUL
• Dział Projektów Naukowych
• Dział Ewaluacji Działalności Naukowej
• Szkoła Doktorska KUL
• Biuro Regionalnej Inicjatywy Doskonałości
• Wydawnictwo KUL
• Centrum Badań nad Historią Polskiego Państwa na Uchodźstwie
• Centrum Komercjalizacji Nauki
• Rzecznik patentowy
• Laboratorium Humanistycznych Danych Badawczych KUL
• Centrum Studiów Mediewistycznych
• Centrum Relacji Katolicko-Żydowskich im. Abrahama J. Heschela KUL
• Centrum Oceny Nauki i Techniki
• Centrum Badań nad Organizacjami Polonijnymi za Granicą

Pion Prorektor ds. kształcenia:

• Dział Kształcenia
• Dział Projektów Akademickich
• Uniwersyteckie Centrum Rozwijania Kompetencji
• Biuro Karier KUL
• Szkoła Języka i Kultury Polskiej
• Studium Języków Obcych
• Studium Wychowania Fizycznego i Sportu
• Centrum Polsko-Chińskie KUL
• Centrum Dydaktyki Akademickiej
• Akademia Polonijna KUL
• Centrum Arbitrażu i Mediacji
• Centrum Zastosowań Sztucznej Inteligencji

Pion Prorektor ds. studentów, doktorantów i rozwoju:

• Dział Studenckich Spraw Socjalnych
• Dział Administracji Domami Studenckimi
• Dział Współpracy z Zagranicą
• Dział Strategii  i Rozwoju Uniwersytetu
• Centrum Aktywizacji Osób z Niepełnosprawnością KUL
• Centrum Badań nad Dyplomacją KUL
• Organizacje studentów i doktorantów

Pion Prorektora ds. misji i cyfryzacji:

• Muzeum KUL
• Dział obsługi Filii KUL w Stalowej Woli
• Dział Systemów Informatycznych
• Dział Teleinformatyczny
• Laboratorium Innowacji
• Duszpasterstwo Akademickie

Pion Prorektora ds. administracji:

• Dział Administracji Obiektami KUL
• Archiwum Uniwersyteckie
• Dział Ochrony, Bezpieczeństwa i Higieny Pracy
• Centrum Edukacyjno-Kongresowe KUL w Tomaszowie Lubelskim
• Dział Zakupów i Zamówień Publicznych
• Dział Inwestycji i Remontów
• Kancelaria Tajna

Pion Kwestora:

• Kwestor
  • Dział Finansowy
  • Dział Księgowości
  • Dział Analiz Finansowo-Budżetowych